и время выполнения скрипта тогда тоже смотри
а то будет отрубать, если превысишь лимит в несколько секунд.
ты поиск по файлу сделай - и смотри где size. что-то типа:
output_buffering = 4096 или post_max_size = 8M или upload_max_filesize = 2M
Добавлено через 40 секунд
pdo_mysql.cache_size = 2000