[Xen]

Мб ОС в это время делает снимок или сжимает или дефрагментаторы в фоне крутятся, не? Мб стоит в системный журнал заглянуть и посмотреть события? С включеннм диспечером задач "ловить" лаг и спотреть, какой процесс в это время хвавет процессорное время, т.о. ты выведешь негодяя на чистую воду. ОС какая? В диспечере устройств нет восклицательных или вопрос. знаков на иконках устройств? Драйвера пробывал через удаление переустанавливать? мало инфы, скрины эти ничего не говорят, почти + данные этой софтины могут расходится с реальными

Врятли это железо так, имхо по описанию дело в софте.